O PEC, de maneira geral, possui o objetivo de formar recursos humanos capazes de abordar, de modo consistente, com os avanços científicos e tecnológicos contemporâneos, questões ligadas à Engenharia Civil e à Engenharia Sanitária e Ambiental. Esses recursos humanos serão capazes de criar novos conhecimentos científicos, executar atividades de pesquisa e desenvolvimento, atuando de forma assertiva em projetos técnicos, quer seja em centros acadêmicos, atuando como professores ou pesquisadores, quer seja em indústrias ou em empresas dos setores público e/ou privado.
Além disso, observa-se os seguintes objetivos específicos: