Dentre os objetivos específicos do PPGCF, está a possibilitar o desenvolvimento de habilidades didático pedagógicas diferenciadas aos profissionais para atuação destes na docência do ensino superior. Além disso, O PPGCF objetiva qualificar profissionais na área de Ciências Farmacêuticas capazes de desenvolver projetos e métodos de pesquisa para instituições públicas e privadas, bem como o pensamento crítico necessários para o desenvolvimento acadêmico, científico e tecnológico em níveis local, regional, nacional e internacional.