O Programa de Pós-Graduação em Ciência da Religião mantém o conceito 5 na CAPES desde a avaliação acadêmica de 2001. Juntamente com as atividades de ensino, o programa vem incentivando a produção científica dos docentes e discentes com a afirmação dos Núcleos de Pesquisa NERFI, NEMIC e NERCS e das revistas NUMEN e SACRILEGENS.