A Editora UFJF possui 14 (quatorze) Selos Editoriais associados. Estes Selos Editoriais são coordenados e organizados, editorial e operacionalmente, pelos seguintes setores/ unidades da UFJF:
- SELO PPGCOM – Programa de Pós-Graduação em Comunicação/ FACOM;
- SELO PROAC – Programa de Pós-Graduação em Ambiente Construído;
- SELO CLIOEDEL – Departamento de História/ ICH/UFJF;
- SELO GESTÃO E AVALIAÇÃO EDUCACIONAL – Programa de Pós-Graduação em Educação /CAED/ FACED
- SELO CAMINHOS DA PESQUISA EM EDUCAÇÃO – Programa de Pós-Graduação em Educação / FACED
- SELO PROFBIO – Mestrado Profissional em Ensino de Biologia /PROFIBIO/ GV/ JF
- SELO EDUCAÇÃO MATEMÁTICA PARA PROFESSORES – PPG em Educação Matemática /ICE
- SELO SERVIÇO SOCIAL – Programa de Pós-Graduação em Serviço Social
- SELO FACC – Programa de Pós-Graduação em Faculdade de Administração e Ciências Contábeis /FACC
- SELO ENSINO DE LINGUA PORTUGUESA E LITERATURA EM FOCOS – Mestrado Profissional em Letras /PROFLETRAS
- SELO PEC PUBLICAÇÕES – Programa de Pós-Graduação em Engenharia Civil / PEC
- SELO ARTES, CULTURA E LINGUAGENS – Programa de Pós-Graduação em Artes, Cultura e Linguagens /PPG-ACL
- SELO ALDEIA – Programa de Pós graduação do Instituto de Ciências Humanas /ICH
- SELO ESTUDOS DE RELIGIÃO – Programa de Pós graduação em Ciências da Religião
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Fluxo das obras dos selos editoriais – FLUXO EMPRESA TERCEIRIZADA