O biotério de experimentação do CBR constitui um ambiente projetado para o alojamento, manejo e cuidado de animais utilizados em atividades de pesquisa. Sua estrutura inclui salas equipadas com racks e estantes ventiladas para o alojamento de ratos e camundongos. Esse local dispõe também de salas destinadas à realização de procedimentos gerais e minimamente invasivos, bem como de áreas exclusivas para a realização de cirurgias que envolvam algum grau de invasividade. Complementando a estrutura, o biotério de experimentação dispõe de equipamentos voltados para testes comportamentais e uma sala específica equipada com gaiolas metabólicas, utilizadas para a coleta de amostras de fezes e urina, bem como para o controle do consumo de água e ração.