Modelagem Molecular de Fármacos a Sondas Fluorescentes em Soluções e Membranas
Efeito de solventes é um tema atual e importante para compreensão de fenômenos moleculares em processos químicos e biológicos. O grande desenvolvimento de métodos teóricos para estudar este tema foi conseguido através das idéias do meio contínuo dielétrico como o encontrado na Teoria de Campo de Reação. Em anos mais recentes, a necessidade de considerar efeitos estatísticos e interações específicas deu origem aos métodos baseados em simulações computacionais. Nosso interesse particular está centrado na modificação da estrutura conformacional e eletrônica de moléculas em solução homogêneas, misturas binárias e bicamadas lipídicas, levando em conta os efeitos do meio e da temperatura. Para isto, desenvolvemos procedimentos teóricos utilizando métodos híbridos QM/MM que combinam mecânica quântica (QM) e mecânica molecular (MM). Nesta palestra apresentaremos estudos recentes em moléculas de interesse biológico [1-4].
[1] “Protonation/deprotonation process of Emodin in aqueous solution and pKa determination: UV/Visible spectrophotometric titration and quantum/molecular mechanics calculations”, A. R. da Cunha, E. L. Duarte, M. T. Lamy, K. Coutinho, Chem. Phys. 440 (2014) 69-79.
[2] “Electric Dipole Moments Of The Fluorescent Probes Prodan And Laurdan: Experimental And Theoretical”, C. C. Vequi-Suplicy, K. Coutinho, M. T. Lamy, Biophysical Reviews 6, (2014), 63-74.
[3] “Born-Oppenheimer molecular dynamics and electronic properties of chlorophyll-c2 in liquid methanol”, B. J. C. Cabral, K. Coutinho, S. Canuto, J. Chem. Phys., 138 (2013) 225102.
[4] “Molecular Dynamics Investigations of Prodan in a DLPC Bilayer”, W. Nitschke, C. Vequi-Suplicy, K. Coutinho, H. Stassen, J. Phys. Chem. B, 116, 2713–2721 (2012).