Prof. Dr. Rodrigo Alves Dias (UFJF)
Resumo: Neste trabalho apresentamos um modelo computacional para células. O modelo considera basicamente a membrana celular, a membrana nuclear e os filamentos de actina. A membrana nuclear está conectada à membrana celular através do filamento de actina. A constituição da membrana celular, núcleo e filamento é extremamente complexa, mas pode ser modelada de forma muito simples se considerarmos que as membranas são formadas por “aglomerados de partículas” (esferas) e as ligações entre as esferas são realizadas por um potencial elástico (FENE), um potencial angular (Bending) e um potencial de caroço duro (WCA). As constantes dos potenciais desempenham aproximadamente o papel das ligações químicas entre os lipídios. Todas as massas das esferas são iguais. Realizamos uma simulação de Dinâmica Molecular Clássica, utilizando um banho térmico para manter a temperatura constante. O modelo foi construído em 2D, pois isso facilita o tempo computacional e também a análise dos resultados. Adicionamos a célula
entre duas paredes. A parede superior é rígida e lisa, já a inferior é móvel e possui atrito. Após realizarmos uma constrição na célula, ou seja, a distância entre as paredes será menor que o raio da célula, acompanhamos a evolução das posições de todas as partículas e medimos as propriedades do centro de massa das células. Observamos que o movimento da célula não é randômico para certos parâmetros dos potenciais, e esta fenomenologia pode ser relacionada com a migração de células em organismos vivos [1].
Referência
[1] https://doi.org/10.1101/2024.01.02.573660